Hola, MARIA.MM.
Obviamente las explotaciones ganaderas estás sujetas a la aparición de zoonosis, aunque es cierto que van más enfocados a trabajadores de la propia instalación, ya que están en contacto directo con las fuentes de posible contagio (manipulación de reses muertas o enfermas, crías y placentas; limpieza de zonas de estabulación con animales enfermos, picaduras de insectos, etc.)
Así a bote pronto y sin conocer más detalles, a mí me parece algo exagerado entrar a valorar este riesgo para la empresa que realiza la instalación (igual que si entraran a trabajar en un hospital), más allá de una adecuada coordinación de actividades con la empresa titular en este sentido (si es un particular, olvídate de esto) y quizá un protocolo de higiene (ropa distinta de la calle, EPI que se puedan lavar bien, no aplastar bichos contra la piel, evitar la acceso innecesario a zonas con foco de riesgo, e incluso que los trabajadores se duchen después de trabajar allí).
Si realizan este tipo de instalaciones de forma habitual, tampoco estaría de más darle una vuelta al tema de la vacunación, en especial del tétanos.
Saludos.
Cada vez que das las "gracias" pones la sonrisa en la cara de un niño. En la mía, vaya. No seas rata con los agradecimientos.